1. Распаковываем hitbox_fix-bin-X_X.zip в папку <gamedir> вашей игры.
2. Добавляем библиотеку hitbox_fix_mm_i386.so или hitbox_fix_mm.dll в зависимости от используемой ОС в конфиг MetaMod.
Для этого открываем <gamedir>/addons/metamod/plugins.ini (если его нет, создаем сами) и пишем:
Linux:

linux addons/hitbox_fix/hitbox_fix_mm_i386.so

Windows:

win32 addons\hitbox_fix\hitbox_fix_mm.dll

3. Копируем hbf.cfg в директорию, где лежит библиотека hitbox_fix (addons/hitbox_fix/)